葉綠素儀和葉綠素熒光儀無(wú)論在研究目的、測量方法、使用方法和使用對象上有很大的區別。  

就研究目的而言，當人們選擇熒光儀時(shí)多是以研究光合作用的機理問(wèn)題如，電子傳遞的過(guò)程和效率，光合反應中心II（PSII）和反應中心I（PSI）的功能，環(huán)境變化（干旱，鹽堿，金屬污染）對電子傳遞的影響等為目的。而葉綠素儀則主要用于判斷植物生長(cháng)過(guò)程中的營(yíng)養狀況（特別是氮素水平），為作物施肥提供生產(chǎn)上的參考。概括講，葉綠素熒光儀用于理論研究，而葉綠素儀用于應用研究。  

在測量方法上，熒光儀是利用葉綠素*的熒光現象，采用*靈敏度和反應速度的傳感器，輔以光電脈沖設計來(lái)捕獲電子傳遞過(guò)程中的各時(shí)段上的熒光數據。熒光測量是一個(gè)過(guò)程測量。而葉綠素儀是利用葉綠素對紅光的特殊吸收特性，利用光電傳感器對紅光吸收量多少的測定。葉綠素儀的測量是在某一時(shí)，某一點(diǎn)上的瞬時(shí)測量。  

從使用方法上講，熒光儀的使用需要對葉片進(jìn)行較長(cháng)時(shí)間的暗處理，而葉綠素儀則需要化時(shí)間去做不同樣品的訂正曲線(xiàn)。